层次上有区别：一级主任科员要高于二级主任科员；重要性上有区别：如果你想享受副处的待遇，必须先从二级主任科员晋升一级主任科员，相当于一级主任科员是晋升四调的一个关卡，因此在重要性上远远高于二级主任科员。
一级科员与一级主任科员的区别
一是职级差别比较大。
从这个职级序列中可以看出，一级科员实际上就是办事员，在公务员序列中，是属于职级最低的，由于职级和工资、福利等待遇是挂钩的，在科员职级中只有两个职级，一级和二级，二级是最低的。从二级可以晋升到一级，但都是办事员的级别，不过由于晋升通道是畅通的，经过努力一级科员是可以逐步晋升的。
二是一级主任科员是科员中的最高等级。
从职级层次来看，一级主任科员在名称上多了“主任“”两个字，一级主任科员和一级科员相比相差了四个级别。
三是一级主任科员职级高于乡科级正职。
按照公务员的领导职务和对应的最低职级层次来看，乡科级正职对应的职级二级主任科员；乡科级副职对应的职级是四级主任科员。一级主任科员的职级还要高于乡科级正职领导职务，但一级科员没有对应的领导职务。
四是一级主任科员的级别高于一级科员。
从职级对应的级别来看，一级主任科员是从21级至15级；一级科员是从26级至18级。一级主任科员比一级科员的行政级别高3到5个级别。
五是从晋升通道来看。
要从一级科员晋升到一级主任科员，按照正常的程序和比较顺利的情形下，一级科员要晋升到四级主任科员需要满2年以上，从四级主任科员晋升到三级主任科员需要2年以上，从三级主任科员晋升到二级主任科员需要2年以上，从二级主任科员晋升到一级主任科员需要2年以上。
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